Un ecosistema en equilibrio es crucial para la conservación de especies que se benefician mutuamente a través del hábitat o los servicios que comparten. Las relaciones entre los sistemas agroforestales y las comunidades de murciélagos son esenciales para el mantenimiento del ecosistema. Los murciélagos (Orden Chiroptera) son mamíferos voladores nocturnos con alrededor de 1.100 especies que incluyen insectívoros, frugívoros, nectarívoros y carnívoros. Los sistemas agroforestales, además de proporcionar una fuente importante de alimentos, también sirven como refugio para los murciélagos, particularmente los frugívoros e insectívoros, que desempeñan funciones decisivas como la dispersión de semillas y el control de plagas. Sin embargo, un manejo inadecuado del ecosistema puede fragmentarlo, afectando a la diversidad y abundancia de estas comunidades. Este estudio tiene como objetivos analizar la diversidad y abundancia de murciélagos con respecto a los sistemas agroforestales con diferente grado de intervención en la provincia de Napo, identificar los papeles funcionales de los quirópteros, e indagar, a través de una entrevista a los comuneros, sobre sus conocimientos respecto al uso de agroquímicos y la importancia ecológica de los murciélagos. Esto último se complementa con un taller de concientización sobre la importancia de los murciélagos en el ecosistema. Se espera encontrar una menor diversidad de murciélagos en sistemas agroforestales con mayor intervención y mayor diversidad y abundancia en áreas con. menor intervención, destacando la necesidad de prácticas sostenibles para mantener la biodiversidad y los servicios ecosistémicos que los murciélagos proporcionan.