Los problemas de contaminación en el ámbito local, nacional e internacional son parte de nuestra vida cotidiana; por tanto es preocupante la manera en cómo se han ido degradando los ecosistemas de nuestro planeta, y la capa superficial de la corteza terrestre no es la excepción.La actividad petrolera en sus diferentes etapas ocasiona contaminación y cambios en el uso del suelo.Durante estos últimos 25 años se ha registrado al menos 1.983 derrames de petróleo en la región Amazónica, siendo este último registrado en el sector Piedra Fina de la provincia de Napo. Puesto que el petróleo es un material natural, puede ser diluido o descompuesto por bacterias y otros agentes naturales. Sin embargo, los productos refinados del petróleo (gasolina, kerosén, asfalto, aceite combustible, y otros productos petroquímicos) no son naturales. En la presente investigación una vez recolectadas muestras de suelo obtenidas del sector Piedra Fina de la provincia de Napo, se aislará y enriquecerá bacterias presentes en el medio de cultivo, después del aislamiento se extraerá su ADN para llevarlo a secuenciar mediante el gen 16S ARN ribosomal el cual finalmente con base de datos bioinformáticos nos revelaran de que domino o genero de estos microorganismos. Con esta investigación se espera resultados en los cuales identificando los diferentes microorganismo presentes en suelos contaminados por petróleo, estos se puedan usar en técnicas de biorremediacion y restauración de suelos contaminados por estos contaminantes.