El incremento de la frecuencia e intensidad de eventos extremos de temperatura representa un reto para la adaptación de las especies. Organismos ectotermos, como los insectos, dependen intrínsecamente de fuentes externas para la regulación de su temperatura corporal, enfrentando un dilema singular en su supervivencia y adaptación. Dentro del orden Lepidóptera, Heliconius erato lativitta es una mariposa que habita los bosques del Neotrópico y ha sido estudiada por varios siglos mostrando evidencia de la repercusión del estrés térmico en su ciclo de vida. Si bien se sabe que existen proteínas de choque térmico (Hsp) que mitigan la desnaturalización de proteínas y mantienen la homeostasis celular, los mecanismos epigenéticos subyacentes en esta especie siguen sin resolverse. Este estudio profundiza el entendimiento de la expresión génica de dos familias de proteínas de este grupo, Hsp40 y Hsp90 en H. e. lativitta bajo estrés térmico, usando tejidos cefálicos, torácicos y abdominales en individuos machos y hembras, mediante RT-qPCR y el método de doble delta de Livak (ΔΔCt). A través de un alineamiento local se identificó dos genes de la familia Hsp40, los homólogos DnaJ-1 y DnaJ-5, los mismos que muestran infraexpresión a 40 °C y sobreexpresión a 5 °C. Mientras para la familia Hsp90 se identificó un gen homónimo con sobreexpresión a 40 °C. Los tejidos abdominales y cefálicos exhibieron la mayor sobreexpresión entre las tagmas, y el tórax, infraexpresión en todos los escenarios. El uso de modelos lineales generalizados demostró que la variabilidad en la expresión génica fue inducida principalmente por los tratamientos de temperatura y en menor medida, por variación entre tipos de tejidos. No se evidenció diferencias significativas entre sexos. Este estudio permite entender los mecanismos epigenéticos de adaptación en mariposas tropicales ante la crisis climática, proporcionando una plataforma para futuras investigaciones sobre resistencia y adaptación a estresores ambientales.