Se evaluó el agua efluente de lagunas de oxidación, y su tratamiento posterior mediante oxidación avanzada. El objetivo fue determinar la efectividad de los tratamientos con carbón activado para inhibir microorganismos resistentes a antibióticos (MRA) en estos efluentes. Todos los tratamientos con ozono fueron efectivos para inhibir el crecimiento de coliformes totales. El uso de carbón activado (CA) y modificado (CAM) con hierro durante la ozonificación de 2 horas mostró una notable eficacia en la inhibición de los coliformes totales. Estos hallazgos resaltan el potencial de los tratamientos de ozono en combinación con el uso de carbón activado para la desinfección y control de la contaminación microbiológica en el agua. Los microorganismos aislados fueron resistentes a los fármacos bacitracina y ampicilina, sin que los tratamientos modificaran esta resistencia. Sin embargo, se observaron efectos de sensibilidad en todas las etapas del tratamiento para los fármacos amikacina y levofloxacina. Este estudio destaca la efectividad de los tratamientos con carbón activado y ozono en la mejora de la calidad del agua, la remoción de turbidez y la inhibición de los coliformes totales, proporcionando información para abordar la contaminación y conservación de los recursos hídricos.