Se evaluó el Índice de Temperatura Humedad (ITH) en la provincia de Manabí durante el fenómeno de El Niño 1997-1998. Se recopilaron datos climatológicos mensuales (n=556 por variable) de temperatura (°C) y humedad relativa (%) de las estaciones meteorológicas Camposano 2, Chone, Jama, Julcuy, Portoviejo, Rocafuerte y Olmedo entre 1995 y 2001 y se utilizaron para calcular el ITH. Se aplicó análisis estadístico descriptivo y de Kruskal-Wallis. Durante el análisis, el ITH superó el umbral máximo de confort (<72), indicando condiciones para estrés calórico en bovinos Bos taurus y sus cruces con Bos indicus. Se encontró diferencia altamente significativa (p<0.01) entre estaciones meteorológicas, años, meses y estación climática evaluadas para todos los parámetros. Se identificó un patrón anormal en 1997 y 1998 con ITH promedio de 78.09±0.87 y 77.47±2.32 respectivamente, y coincide con el análisis estadístico al presentar diferencias entre sí, y estos, con los demás años analizados que presentaron patrones normales en cada estación meteorológica. Al evaluar por estaciones climática, el ITH medio en invierno fue 77.59±1.29 y en verano 75.51±1.77, correspondiendo el verano a los meses entre junio y noviembre, que a la vez no difirieron entre sí y se ajustaron en un solo grupo sin diferencias estadísticas con promedios de ITH entre 75.25 y 76.02, el ITH medio más alto concernió al mes de marzo (78.25±0.93). El estrés calórico afecta la respuesta termorreguladora en bovinos Bos taurus y cruces, por lo tanto, se debe implementar estrategias de mitigación en las ganaderías de la provincia, especialmente con la aproximación de un nuevo fenómeno de El Niño.