El deterioro de un edificio es un proceso natural de degradación de sus materiales, se acelera con su uso y puede ser controlado a través de la ejecución oportuna de actividades de mantenimiento. La escasez de recursos económicos asignados para el mantenimiento de edificios universitarios es un problema que se evidencia en el deterioro de sus instalaciones y tiene efecto sobre el desarrollo de las actividades de sus usuarios. El propósito de este trabajo fue diseñar una metodología para evaluar el grado de deterioro de edificios universitarios construidos en hormigón armado, ubicados en la sierra centro del Ecuador. La investigación tuvo un enfoque mixto, se aplicó la técnica de análisis multicriterio “Proceso Analítico Jerárquico” para determinar las ponderaciones de los sistemas que componen el edificio, y los criterios de evaluación, mediante la consulta a expertos en el área. Se desarrolló un cuestionario para evaluar el estado físico (EF) de cada sistema y el efecto resultante (ER) sobre los usuarios. Los resultados indican que el criterio de evaluación EF tiene una ponderación de 72.9% y el criterio ER de 27.1% en el sistema de evaluación. En general de nueve sistemas que componen un edificio universitario, los tres más importantes son: la estructura, el sistema hidrosanitario y el sistema eléctrico. El método propuesto vincula una escala cuantitativa, con una cualitativa; en donde el grado más bajo va de 0 a 27 puntos y corresponde a un estado “Peligroso”, mientras que el nivel más alto es el estado “Satisfactorio” para un edificio que obtenga una puntuación de 292 a 500 puntos. Se concluye que la propuesta tiene validez y aplicabilidad, verificadas en la etapa de validación. Esta metodología proporciona un criterio técnico para priorizar la asignación de recursos para mantenimiento de edificios o sistemas que se encuentren en estado deficiente.