La soya es una de las oleaginosas más importantes en el mundo en el aspecto económico y nutricional. Debido a su alto contenido de nutrientes, esta planta ha ganado gran importancia en la industria alimenticia para la elaboración de aceites, concentrados y balanceados para nutrición bovina, porcina y aviar. Actualmente, en Ecuador existe una cantidad limitada de 12,694 hectáreas en cultivos de soya, a pesar de la aparición de numerosas variedades certificadas que permiten su siembra. El área de siembra se centra mayoritariamente en la región costa del país. Es evidente que, a pesar de ser un cultivo con un gran potencial, las investigaciones nacionales de fitomejoramiento y adaptabilidad de esta planta han dejado de lado a la región amazónica. Además, la producción nacional de esta oleaginosa es notablemente menor a la de los países vecinos y se debe importar soya ya que la producción total no sustenta la demanda de consumo nacional de este producto. De esta manera, el objetivo de este estudio es evaluar el rendimiento de cuatro variedades de soya que fueron desarrolladas y certificadas para el litoral ecuatoriano (INIAP 307, INIAP 308, Panorama y Vinces UG 2) al cultivarse en la ciudad de Tena, dentro de la Amazonía ecuatoriana. Se obtendrán datos del porcentaje de germinación, área foliar, tiempo a floración, altura media, número de vainas, número de semillas por vaina y porcentaje de transformación de flores en vainas. En la experimentación se aplicará un diseño de bloques completamente al azar con 4 tratamientos y tres repeticiones, una en invernadero y otra campo abierto. A partir de los datos obtenidos, se seleccionarán variedades para cruza y producción de una generación F1. Finalmente, se identificarán los ejemplares pertenecientes a la F1 mediante de la utilización de marcadores moleculares InDel. Los resultados de esta investigación serán directamente transferibles a los agricultores locales y constituirán la base para crear poblaciones segregantes de soya para futuros estudios de mapeo genético. Los datos recolectados en este estudio podrían ser utilizados en futuras investigaciones sobre la introducción sostenible de la soya en el sistema de producción amazónico “Chacra”.