La tuberculosis bovina (bTB), causada por la bacteria Mycobacterium bovis, representa un problema de importancia sanitaria, económica y zoonótica a nivel mundial, debido a su impacto sobre la salud animal, la salud pública y la biodiversidad. En Ecuador, especialmente en zonas rurales y áreas de amortiguamiento con alta interacción entre bovinos, fauna silvestre y seres humanos, el riesgo de transmisión aumenta considerablemente. La zona de amortiguamiento de la Reserva Biológica Reserva Biológica Colonso Chalupas constituye un área de interés epidemiológico debido a la convivencia entre animales domésticos y especies silvestres potencialmente involucradas en la dinámica de transmisión de enfermedades zoonóticas. Sin embargo, la información disponible sobre la presencia de M. bovis en esta región es limitada, lo que dificulta el establecimiento de estrategias de vigilancia y control sanitario.

La presente investigación tiene como objetivo detectar molecularmente micobacterias e identificar la presencia de Mycobacterium bovis en muestras de hisopado bovino provenientes de la zona de amortiguamiento de la Reserva Biológica Colonso Chalupas mediante técnicas de qPCR y PCR convencional. Para ello, se recolectarán muestras de hisopado nasofaríngeo de bovinos ubicados en las localidades de Cotundo, km 15, Jondachi y Merced de Guacamayos, siguiendo protocolos de bioseguridad y bienestar animal. Posteriormente, se realizará la extracción de ADN utilizando el kit Quick-DNA/RNA Viral Kit (Zymo Research). La detección inicial del complejo Mycobacterium tuberculosis se llevará a cabo mediante qPCR dirigida a la secuencia IS6110, empleando cebadores específicos y análisis de curvas de disociación para verificar la especificidad de la amplificación. Finalmente, las muestras positivas serán confirmadas mediante PCR convencional a través de la amplificación de la región de diferencia RD4, permitiendo la diferenciación molecular de Mycobacterium bovis.