La caracterización de la diversidad biológica mediante herramientas moleculares es fundamental para comprender los procesos evolutivos en ecosistemas tropicales. En este contexto, el género Macrobrachium (Decapoda: Palaemonidae) representa un grupo clave en ecosistemas dulceacuícolas amazónicos, donde cumple funciones ecológicas esenciales y constituye un recurso de importancia local. No obstante, los estudios sobre su diversidad en Ecuador siguen siendo limitados, y la taxonomía clásica enfrenta dificultades debido a la amplia distribución geográfica y la marcada plasticidad ecológica del grupo.
El presente estudio analizó la diversidad genética y filogenética de Macrobrachium spp. en la cuenca alta del río Napo, a partir de los genes mitocondriales COI y 16S. El diseño metodológico incluyó muestreos en 12 sitios durante dos épocas del año, extracción, amplificación y secuenciación de ADN, así como análisis filogenético bajo un enfoque de máxima verosimilitud.
Los resultados revelaron tres linajes genéticamente distintos dentro del área de muestreo, en ellos, dos linajes correspondientes a M. brasiliense y M. veredensis, respaldados por altos valores de soporte nodal. La distancia genética para COI varió entre 6.72 y 14.80% (p-D promedio = 10.68 ± 0.40), mientras que para 16S osciló entre 2.39 y 10.14% (p-D promedio = 7.41 ± 0.21). Estos valores sugieren la presencia de diversidad críptica, particularmente en M. brasiliense.
La identificación de linajes únicos y potenciales nuevas especies resalta la importancia de profundizar en estudios taxonómicos y biogeográficos. Asimismo, subraya el valor de la biotecnología molecular como herramienta para la conservación y el manejo sostenible de la biodiversidad en ecosistemas tropicales.