La presencia de metales pesados en el suelo puede influir en la calidad ambiental y la salud de los ecosistemas, especialmente en zonas de alto valor ecológico como el piedemonte amazónico. Este estudio tiene como objetivo establecer una línea base geoquímica para los elementos S, V, Cr, Zn, As y Ba en la zona de amortiguamiento de la Reserva Biológica Colonso Chalupas, en el sector Alto Tena, provincia de Napo, Ecuador, a fin de evaluar su origen y determinar su aptitud para uso agrícola. El área de estudio comprende 15 ha de bosque secundario sobre depósitos aluviales, donde se aplicó un muestreo sistemático en malla de 70 × 70 m con 30 puntos, cada uno conformado por cinco submuestras extraídas entre 20 y 40 cm de profundidad. Las muestras fueron analizadas mediante fluorescencia de rayos X y los datos procesados estadísticamente mediante el método iterativo de dos desviaciones estándar para definir umbrales naturales y detectar anomalías. Los resultados indicaron promedios de 123,2 ppm (V), 64,5 ppm (Cr), 42,7 ppm (Cu), 82,7 ppm (Zn), 9,4 ppm (As) y 425,9 ppm (Ba). V, Cr, Cu y Zn superaron los límites establecidos en la normativa ecuatoriana, pero se ubicaron dentro del rango natural del fondo geoquímico local, evidenciando un origen litogénico y un enriquecimiento natural asociado a rocas máficas-ultramáficas. El As se mantuvo por debajo del límite normativo, mientras que el Ba superó tanto la norma como parte del rango natural inferior, con concentraciones más altas cerca de cursos de agua. En conclusión, la geoquímica de los suelos refleja la composición natural del sustrato, con enriquecimiento natural de ciertos elementos, y presenta condiciones no aptas para la agricultura, ya que supera los límites establecidos en la normativa ecuatoriana, especialmente en el caso de Ba y As.