El género Astroblepus es un grupo de peces emblemático de los Andes tropicales. Su capacidad para escalar superficies verticales, junto con su aislamiento en cuencas hidrográficas independientes, ha favorecido un alto nivel de endemismo a escalas microgeográficas. En Ecuador se reconocen 24 especies, distribuidas en regiones subtropicales, templadas y altoandinas, con 14 presentes en la vertiente occidental, de las cuales 9 son endémicas y presentan desafíos para su conservación. Históricamente, la investigación ha sido limitada por la dificultad de establecer criterios confiables para delimitar especies, debido a descripciones ambiguas, diversidad críptica y plasticidad morfológica del grupo. Este estudio aplicó un enfoque taxonómico integrador mediante técnicas de morfometría geométrica, análisis moleculares y caracteres morfológicos tradicionales para evaluar la diversidad de especies dentro del género Astroblepus en la cuenca del río Esmeraldas, donde actualmente se reconocen cinco especies. Los análisis individuales y combinados identificaron seis especies, superando la estimación previa. Se confirmó la validez de A. eigenmmani y A. fissidens como especies formales, mientras que A. mindoensis y A. theresiae se recuperaron como posibles sinónimos. Dentro de A. cyclopus identificamos dos linajes crípticos y se descubrieron A. aff. mindoensis y A. sp como dos posibles especies nuevas, caracterizadas por autopomorfias moleculares y morfológicas. Estos resultados revelan la complejidad evolutiva en la cuenca y como la distribución altitudinal y el aislamiento entre subcuencas han sido claves para la divergencia. Asimismo, este estudio demuestra la importancia de usar múltiples metodologías para comprender la diversidad taxonómica de este grupo.
Palabras clave: Astroblepidae, diversidad críptica, DNA barcoding, morfometría geométrica, taxonomía integrativa, cuenca del río Esmeraldas.