Las amenazas naturales y antrópicas están deteriorando la biodiversidad herpetológica a nivel mundial. Ecuador, considerado uno de los países megadiversos en anfibios y reptiles, enfrenta actualmente presiones y amenazas sobre sus ecosistemas naturales. Sin embargo, vacíos de información biogeográfica sobre la distribución de especies y sus amenazas, limitan la comprensión de las interacciones humano-fauna. En este estudio modelamos la Superficie de Riesgo Ambiental (ERS, en inglés) para identificar espacialmente las amenazas más graves a la herpetofauna ecuatoriana, priorizar áreas críticas y proponer acciones de conservación. La metodología incluyó cuatro etapas: (1) identificación y clasificación de amenazas con base en criterios jerárquicos y validación de expertos; (2) recopilación de información geográfica de calidad sobre las amenazas (shapefiles y ráster); (3) asignación de valores de intensidad y distancia de influencia mediante funciones de decaimiento derivadas de literatura científica; y (4) aplicación de un análisis jerárquico ponderado (AHP) con participación de especialistas en herpetofauna. El procesamiento espacial se realizó en ArcMAP 10.5, generando capas ráster con valores entre 0 y 1. Los resultados muestran que, para los anfibios, las principales amenazas provienen de la agricultura, infraestructura (carreteras y oleoductos), áreas de producción (minería y petróleo) y deforestación. En el caso de los reptiles, las mayores presiones corresponden a las actividades extractivas, seguidas por la expansión agrícola, acuícola y la explotación forestal. Desde una perspectiva biogeográfica, los bosques piemontanos andinos, la planicie costera y el norte amazónico concentran las mayores amenazas para los anfibios; mientras que, para los reptiles, se destacan los distritos mineros al sur y centro del país, concesiones sobre el río Jatunyacu y los campos petroleros en la Amazonía norte. Las actividades extractivas y la deforestación representan los principales factores de deterioro en la conservación de la herpetofauna en Ecuador, evidenciando la urgencia de integrar información biogeográfica en estrategias de conservación.