Tradicionalmente, la identificación de péptidos bioactivos en anfibios se lleva a cabo mediante clonaje molecular, técnica que emplea cebadores específicos para amplificar transcritos (ARNm) de péptidos. Sin embargo, esta estrategia presenta limitaciones, ya que la eficacia depende de la similitud de los cebadores con secuencias de los precursores peptídicos, lo que restringe la diversidad de péptidos descubiertos. Frente a estas restricciones, la transcriptómica se consolida como una herramienta innovadora, capaz de analizar de manera masiva los transcritos expresados y permitir la identificación de un repertorio más amplio de péptidos cutáneos. El presente estudio tuvo como objetivo analizar el transcriptoma de la piel de Agalychnis spurrelli para identificar y caracterizar péptidos bioactivos. Para ello, el ARN mensajero se extrajo a partir de la pie y de secreción cutánea mediante perlas magnéticas y se construyeron bibliotecas de ADNc que fueron secuenciadas en la plataforma Illumina. Posteriormente, las lecturas obtenidas se sometieron a un control de calidad con FastQC y a la eliminación de adaptadores y bases de baja calidad mediante Trimmomatic. El ensamblaje se realizó con Trinity y los transcritos resultantes se depuraron con CD-HIT para reducir redundancias. Las secuencias se procesaron con TransDecoder en Galaxy para predecir marcos de lectura abierta y luego fueron filtradas mediante un script en R orientado a identificar regiones conservadas del péptido señal. Finalmente, las secuencias candidatas se compararon mediante BLASTp con bases de datos de péptidos previamente descritos en el NCBI. Como resultado, se identificaron 14 secuencias correspondientes a péptidos bioactivos ya reportados y se descubrieron 3 secuencias de péptidos nuevos. Estos últimos fueron caracterizados in silico. Este estudio demuestra la utilidad del análisis transcriptómico en el descubrimiento de péptidos bioactivos de la piel de anfibios.