Ilex guayusa Loes., es una planta amazónica de creciente interés científico y comercial, la cual se ha caracterizado tradicionalmente por su contenido en cafeína; sin embargo, estudios recientes revelan que posee altas concentraciones de ácidos clorogénicos (CGA), metabolitos con reconocida actividad antioxidante y potenciales beneficios en patologías cardiovasculares, metabólicas y neurodegenerativas. El objetivo de este trabajo fue perfilar e identificar los isómeros de ácidos cafeoilquínicos en I. guayusa bajo diferentes factores ambientales y biológicos: sitio de colecta, edad de la planta y exposición a la luz solar. Se recolectaron hojas en tres localidades de la provincia de Napo, Ecuador (Talag, Alto Pano y Alto Tena), estratificadas en tres grupos de edad (temprana, media y madura) y dos condiciones de luminosidad (sombra y sol). Los extractos fueron analizados mediante cromatografía líquida acoplada a espectrometría de masas de alta resolución (UPLC-QTOF-MS/MS) en modos de ionización positiva y negativa, aplicando un método Data-Dependent Acquisition (FastDDA) y procesados en MZmine. La identificación de metabolitos se realizó a nivel 1 con estándares comerciales y a nivel 2 mediante comparación espectral con bases de datos públicas en GNPS y análisis de redes moleculares (Feature-Based Molecular Networking) visualizadas en Cytoscape. Se identificaron y anotaron múltiples isómeros de ácidos cafeoilquínicos, incluyendo ácido clorogénico y neoclorogénico, así como sus formas oxidadas (quinonas). Los resultados muestran que las mayores abundancias relativas de estos compuestos se registraron en plantas jóvenes expuestas a condiciones de alta luminosidad, lo que evidencia la influencia conjunta de la edad y la radiación solar en la biosíntesis de CGA. En conclusión, este estudio aporta evidencia robusta sobre la variabilidad química de I. guayusa y resalta la importancia de los factores ecológicos en la acumulación de metabolitos con relevancia funcional, contribuyendo a su valoración biotecnológica y al entendimiento de su potencial como recurso nutracéutico