Introducción: La avicultura es un sector clave en la economía ecuatoriana, pero la dependencia de harina de pescado en la alimentación de Gallus gallus domesticus genera impactos ambientales negativos. La harina de larvas de Hermetia illucens se propone como una alternativa sostenible; no obstante, se desconoce su efecto sobre la microbiota intestinal del pollo en condiciones locales. Objetivo: Comparar la diversidad y funcionalidad potencial de la microbiota intestinal de pollos alimentados con harina de pescado frente a dietas con diferentes proporciones de H. illucens. Metodología: Se utilizaron individuos distribuidos en cuatro tratamientos (0%, 25%, 50% y 100% de harina de H. illucens, complementado con harina de pescado). Se evaluaron parámetros como peso y supervivencia. Además, se colectaron 20 muestras del tracto gastrointestinal, se extrajo ADN, y se amplificó la región V4 del gen 16S rRNA mediante PCR de dos pasos. Las muestras fueron secuenciadas por Illumina y se analizarán con herramientas bioinformáticas para evaluar diversidad (índices de Shannon, Simpson y Bray-Curtis) y funcionalidad potencial (PICRUSt2 o Tax4Fun2). Resultados esperados: Hasta ahora, se obtuvo una correcta amplificación (~300 bp), indicando éxito en la preparación de librerías. Se espera encontrar diferencias significativas en la composición microbiana entre tratamientos y un enriquecimiento de funciones asociadas a la digestión, producción de vitaminas y salud intestinal en los grupos con H. illucens. Estos resultados aportarían evidencia a favor de su uso como fuente proteica sostenible y funcional en la nutrición avícola, reemplazando el uso de harina de pescado.

Palabras clave: 16S rRNA, diversidad microbiana, funcionalidad potencial, Hermetia illucens, microbiota intestinal, pollo de engorde, sostenibilidad.