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23-25 julio 2025
America/Guayaquil timezone

Análisis transcriptómico de la piel de la rana 𝑳𝒊𝒕𝒉𝒐𝒅𝒚𝒕𝒆𝒔 𝒍𝒊𝒏𝒆𝒂𝒕𝒖𝒔 en busca de péptidos antimicrobianos

No programado
20m
Oral Traslacional de plantas, Metabolómica y Descubrimiento de biomoléculas en organismos vivos

Ponente

Kevin Alexander Verduga Giler

Descripción

La resistencia antimicrobiana constituye una de las principales amenazas para la salud pública a nivel global, ya que compromete la eficacia de los antibióticos convencionales y limita las opciones terapéuticas disponibles. Esto ha impulsado la búsqueda de nuevas alternativas, como los péptidos antimicrobianos (AMPs) de los anfibios, conocidos por su amplia diversidad y su capacidad para desestabilizar las membranas de los patógenos. La transcriptómica permite analizar los genes que se expresan en un tejido mediante el estudio del ARN mensajero, facilitando la identificación de AMPs. Lithodytes lineatus, una rana amazónica poco estudiada perteneciente a la familia Leptodactylidae, se perfila como una especie de interés, considerando que en especies relacionadas ya se han identificado diversas familias de AMPs. El presente estudio tiene como objetivo analizar el transcriptoma de la piel de Lithodytes lineatus y las interacciones moleculares de un AMP con la membrana plasmática de un microorganismo de interés clínico. Para ello, se extraerá ARNm a partir de muestras de piel conservadas. Posteriormente, se construirán bibliotecas de ADNc que serán secuenciadas utilizando la plataforma Illumina. Las lecturas generadas serán ensambladas de novo con el software Trinity, anotadas funcionalmente mediante Trinotate y comparadas con bases de datos especializadas como NCBI y APD3 mediante el algoritmo BLASTx para identificar posibles AMPs. Las secuencias candidatas serán seleccionadas en función de sus propiedades fisicoquímicas, hemolíticas, modeladas tridimensionalmente con PEP-FOLD3 y evaluadas mediante acoplamiento molecular en AutoDock VINA, utilizando membranas bacterianas simuladas en CHARMM-GUI, con el fin de analizar la afinidad de interacción y los posibles mecanismos de acción de los AMPs identificados. Se espera identificar AMPs con propiedades distintivas, como alta estabilidad estructural, afinidad específica por membrana bacteriana y baja toxicidad, los cuales podrán ser seleccionados para análisis in vitro, aportando una base sólida para el desarrollo de nuevas terapias frente a la resistencia microbiana.

Seminario STIII
Carrera Biotecnología
Evaluador 3 Roque Guillermo Rivas Párraga
Director de Tesis Carolina Del Carmen Proaño Bolaños
Evaluador 1 Cristina Alexandra Quiroga Lozano
Evaluador 2 Nathaly Fernanda Maldonado Taipe

Autor primario

Coautor

Materiales de la presentación

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